Ничего сложного нет. Сначала регистрируете профиль. Потом читаете правила и если отвечаете требованиям, то подаёте заявку, которую должны рассмотреть в течение регламентируемого срока.
Вообще я советую добавлять магазин в ЯндексМаркет. Они последнее время взяли в моду показывать в поисковике только те магазины, которые хоть как-то связаны с их площадкой.
На самом деле они взяли в моду показывать исключительно товары из своего магазина и от тех предпринимателей, кто торгует непосредственно с их площадки. Уже пора бить тревогу и подавать в суд за монополизм.